Vòng loại Giải bóng đá U19 quốc gia - Cúp Sơn KOVA năm 2009 được khởi tranh từ ngày 2 đến 14-1 với sự tham gia của 24 đội bóng được chia làm 3 bảng thi đấu vòng tròn hai lượt để chọn 2 đội đầu bảng vào chung kết. Đội U19 Than Quảng Ninh thi đấu ở bảng A cùng 7 đội là: T&T Hà Nội, Xi măng Hải Phòng, Hà Nội ACB, Xi măng Công Thanh - Thanh Hoá, Nam Định, Thể Công Viettel và Hoà Phát - Hà Nội.
Qua 6 trận thi đấu, trong đó có 3 trận ở SVĐ TX Cẩm Phả, 3 trận ở SVĐ Thuỷ Nguyên (Hải Phòng), đội U19 Than Quảng Ninh đã thắng cả 6 trận (trong đó có trận thắng đậm trước Hà Nội ACB 6-1, thắng Xi măng Hải Phòng 2-0...) được 18 điểm, dẫn đầu bảng A. Các đội sẽ nghỉ Tết Nguyên đán đến 10-2, trong đó trận “khai xuân” đội U19 Than Quảng Ninh sẽ gặp đội U19 Thể Công Viettel.
