Theo tin từ Thanh tra Chính phủ, đến tháng 11-2006 đơn vị này đã hoàn tất, báo cáo Thủ tướng Chính phủ kết quả 14 cuộc thanh tra; chỉ đạo rà soát 25.861 dự án, công trình với mức đầu tư 65.468 tỷ đồng… theo chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ.
Cụ thể, đã kết thúc thanh tra việc đầu tư, mua sắm trang thiết bị của Tổng Công ty Than Việt Nam; việc quản lý rừng phòng hộ và đặc dụng Sóc Sơn, Hà Nội; Công ty liên doanh vận tải biển Việt - Pháp (Gematrans); Công ty cổ phần liên hiệp vận chuyển Sài Gòn (Gemadept); Dự án tăng cường năng lực quản lý giao thông đô thị TP.HCM; Dự án tăng cường năng lực quản lý giao thông đô thị TP Hà Nội.
Kết thúc thanh tra việc đầu tư xây dựng và mua sắm thiết bị Đài Truyền hình TP.HCM và Đài Tiếng nói nhân dân TP.HCM; việc chuẩn bị đầu tư và chuyển giao Dự án xây dựng Khu liên hợp khách sạn số 32-34 Trần Phú, TP Nha Trang, Khánh Hòa; việc đầu tư xây dựng, mua sắm trang thiết bị, cho thuê tài chính tại Ngân hàng NN&PTNT Việt Nam; việc đầu tư, mua sắm trang thiết bị tại Ngân hàng Đầu tư và Phát triển Việt Nam; Dự án Khu đô thị “thành phố giao lưu” tại TP Hà Nội; Dự án đường Hồ Chí Minh (giai đoạn I); Dự án cáp treo chùa Hương.
Qua thanh tra, phát hiện giá trị sai phạm lên tới hàng trăm tỷ đồng, các đoàn thanh tra đã kiến nghị thu hồi nộp ngân sách trên 99 tỷ đồng và trên 200.000USD.
Cũng theo Thanh tra Chính phủ, thời gian tới sẽ kết thúc các cuộc thanh tra tại Công ty Xây dựng I - Bộ Xây dựng (đối với các dự án đầu tư xây dựng khu An Khánh, Bình Trưng, Miếu Nổi, công viên nước Cần Thơ); thanh tra tại cụm dân cư 3 Xuân La, Tây Hồ, Hà Nội; thanh tra Dự án di dân lòng hồ Plei-Krông (Kon Tum); thanh tra tại Tổng Công ty Hàng không Việt Nam; thanh tra tại Ngân hàng Nhà nước. Đồng thời triển khai hai cuộc thanh tra mới tại Tổng Công ty Điện tử & tin học Việt Nam; thanh tra việc xuất bản sách giáo khoa của NXB Giáo dục.
Ngoài ra, thực hiện công điện 496/CĐ-TTg ngày 28/3/2006 của Thủ tướng Chính phủ, năm 2006, Thanh tra Chính phủ đã chủ trì tiến hành thanh tra một số dự án trọng điểm; hướng dẫn, kiểm tra, đôn đốc các Bộ, ngành, địa phương, các tập đoàn kinh tế, Tổng công ty Nhà nước rà soát, tự thanh tra, kiểm tra các dự án, công trình thuộc trách nhiệm quản lý.
Thanh tra Chính phủ đã thành lập tổ công tác trực tiếp đi kiểm tra, đôn đốc việc thực hiện công điện tại 5 Bộ, 15 tỉnh, thành phố và 17 tập đoàn, Tổng công ty Nhà nước.
Đến nay, các đơn vị đã tiến hành rà soát được 25.861 dự án, công trình với tổng mức đầu tư 65.468 tỷ đồng, lựa chọn tự thanh tra, kiểm tra đối với 2.852 dự án với tổng mức đầu tư 11.299 tỷ đồng. Kết quả cho thấy số lượng dự án và nguồn vốn đầu tư thực hiện là rất lớn, nhưng bên cạnh các dự án, công trình phát huy hiệu quả thì còn khá nhiều dự án, công trình có hiệu quả hạn chế, thậm chí không phát huy được hiệu quả đầu tư, dẫn đến lãng phí, thất thoát.
Tình trạng thời gian thực hiện dự án bị kéo dài diễn ra phổ biến (chiếm 67% số dự án được thanh tra, kiểm tra). Số dự án phải bổ sung vốn hoặc có những điều chỉnh, thay đổi khác cũng chiếm tỷ lệ khá cao, xấp xỉ 20% số dự án được thanh tra, kiểm tra.
Thanh tra Chính phủ đã thành lập và chủ trì 5 đoàn thanh tra liên ngành để thanh tra 5 dự án sử dụng nguồn vốn lớn của Nhà nước, vốn ODA; phối hợp với Bộ Giao thông Vận tải, Bộ Công an, Văn phòng Chính phủ rà soát, lựa chọn thanh tra, kiểm tra đối với 2 dự án do PMU 18 quản lý, trong đó có 1 dự án dự kiến sẽ triển khai vào đầu năm 2007.