Từ nhiều năm nay Tổng Công ty Đông Bắc được đánh giá là đơn vị làm tốt công tác bảo vệ môi trường trong ranh giới khai thác sản xuất mà mình quản lý. Công tác này đã đi vào nền nếp từ hàng chục năm nay.
Các thủ tục pháp lý bảo vệ môi trường ở Tổng Công ty Đông Bắc đã đi vào quy chuẩn. Toàn bộ các doanh nghiệp thuộc đơn vị đều có cán bộ chuyên trách về môi trường và hàng năm đều lập báo cáo đánh giá tác động môi trường và xây dựng đề án bảo vệ môi trường. Việc tổ chức quan trắc môi trường thường xuyên theo đúng tần suất quy định đã giúp cho các đơn vị chủ động đưa công tác bảo vệ môi trường đi vào chiều sâu và xây dựng được chiến lược bảo vệ môi trường lâu dài trên những khu vực khai thác. Tất cả các đơn vị trong Tổng Công ty đều được Sở Tài nguyên và Môi trường cấp sổ đăng ký chủ nguồn chất thải nguy hại. Qua đó đơn vị đã ký hợp đồng với những doanh nghiệp có chức năng chuyên môn làm công tác vận chuyển và xử lý triệt để khối lượng chất thải nguy hại. Tổng Công ty đã thực hiện đầy đủ các loại phí bảo vệ môi trường đối với nước thải và trong khai thác khoáng sản. Bên cạnh đó, Đông Bắc đã tiến hành lập các dự án và ký quỹ phục hồi môi trường, đăng ký khai thác tài nguyên nước và xả thải nước qua xử lý ra môi trường. Đến nay việc thu gom, xử lý nước thải mỏ, cải tạo môi trường các hồ đập sông, suối, trồng cây xanh, xây hệ thống kè đập chống sạt lở... đã được Tổng Công ty Đông Bắc đầu tư hàng chục tỷ đồng. Trong 3 năm gần đây Tổng Công ty đã trồng 273 ha cây xanh, trong đó riêng năm 2010 đã phát triển thêm 140 ha. Các bãi thải đã ngừng đổ thải trên địa bàn Tổng Công ty quản lý đều đã trồng xong cây xanh cải tạo môi trường. Đến nay diện tích trồng rừng của Tổng Công ty ước đạt trên 500 ha. Những kết quả đó đã tạo nên nhiều thảm cây xanh trên những vùng đất trống, đồi núi trọc. Từ việc phối hợp với Công ty CP Tin học công nghệ, môi trường TKV, đến nay, các điểm khai thác lộ thiên, hầm lò và cảng chế biến than đều có hệ thống thu gom nước mặt. Các bể lắng đều được xử lý đạt tiêu chuẩn nước thải loại B trước khi xả ra môi trường. Kết quả cải tạo suối đập từ khai trường sản xuất chảy qua các khu dân cư đã được thực hiện trên quy mô lớn. Trong đó có một số công trình tiêu biểu như đập chắn đất đá và suối thoát nước để bảo vệ môi trường khu vực Tây Khe Sim; cải tạo các suối Khe Chàm - Dương Huy và suối Ông Linh; nạo vét và cải tạo 2 hồ lắng tại cảng Khe Dây. Việc triển khai các hệ thống phun sương dập bụi tại các kho chứa, điểm chế biến than và các đường lò trong toàn Tổng Công ty đến nay đã cơ bản hoàn thành. Trên đường mỏ, mỗi đơn vị đều có từ 3 đến 4 xe chuyên dùng thường xuyên tưới nước dập bụi. Trong những năm qua, nhờ làm tốt công tác bảo vệ môi trường nên đến nay, không có đơn vị khai thác chế biến than nào của Tổng Công ty Đông Bắc còn nằm trong danh sách về gây ô nhiễm nghiêm trọng. Đồng thời đơn vị cũng đã chấm dứt việc chở than dọc tuyến đường 18A theo đúng thời gian quy định của TKV. Trong 3 năm gần đây, Xí nghiệp Khe Sim của Tổng Công ty vinh dự được Liên hiệp các hội khoa học và kỹ thuật tặng giải thưởng Thương hiệu xanh phát triển và Thương hiệu xanh bền vững.
Với những kết quả nổi bật trong công tác bảo vệ môi trường, TKV đã tin tưởng giao cho Tổng Công ty thực hiện dự án hoàn nguyên môi trường trọng điểm tại khu vực Khe Sim - Lộ Trí - Đèo Nai (Cẩm Phả) với tổng mức đầu tư 150 tỷ đồng.