Được sự đồng ý của UBND tỉnh và sự tạo điều kiện của các sở, ban, ngành, từ tháng 5-2005 Sở Công nghiệp đã tiến hành xây dựng hệ thống tài liệu theo quy định của tiêu chuẩn ISO 9001:2000; ngoài ra còn xây dựng các quy trình tác nghiệp trong các lĩnh vực đã xác định trong hệ thống quản lý chất lượng. Trong các thủ tục, quy trình đều xây dựng lưu đồ và mô tả công việc chi tiết gắn với trách nhiệm cụ thể từng công đoạn qua phiếu theo dõi hồ sơ, từ đó giúp lãnh đạo kiểm tra và đánh giá được công việc nhằm mục tiêu thoả mãn nhu cầu của các tổ chức, cá nhân có yêu cầu theo đúng quy định của pháp luật với phương châm: “Nhanh - chính xác - đúng pháp luật”.
Để áp dụng Hệ thống quản lý chất lượng theo tiêu chuẩn ISO 9001:2000, Sở Công nghiệp đã tiến hành tổ chức đào tạo cho tất cả cán bộ, công chức cơ quan về Hệ thống quản lý chất lượng theo tiêu chuẩn ISO 9001:2000 để có khả năng tự xây dựng và vận hành hệ thống; đồng thời triển khai đề án tin học hoá công tác quản lý Nhà nước của Sở để đáp ứng yêu cầu nâng cao chất lượng và hiệu quả quản lý. Sau hơn 2 năm triển khai áp dụng Hệ thống quản lý chất lượng theo tiêu chuẩn ISO 9001:2000, hoạt động quản lý hành chính Nhà nước của Sở đã đi vào nền nếp và đạt được kết quả bước đầu theo đúng mục tiêu chất lượng đề ra. 8 tháng đầu năm 2007, Sở đã tiếp nhận 139 hồ sơ, đã trả 132 hồ sơ. Tất cả các hồ sơ được giải quyết đúng trình tự và thường xuyên cải tiến rút ngắn thời gian so với trước đây. Các bộ phận, chuyên viên trực tiếp làm việc đều thể hiện tinh thần trách nhiệm cao, nắm vững các quy định pháp luật hiện hành cũng như các quy định theo thủ tục, quy trình giải quyết công việc. Cơ sở dữ liệu phục vụ cho việc thực hiện công việc được sắp xếp khoa học và được kiểm soát, nhất là các văn bản pháp quy thường xuyên được cập nhật nhằm đảm bảo chất lượng giải quyết các yêu cầu của các tổ chức và cá nhân có nhu cầu. Kết quả áp dụng hệ thống quản lý chất lượng của Sở đã được Trung tâm chứng nhận phù hợp tiêu chuẩn - QUACERT, Tổng Cục Tiêu chuẩn Đo lường Chất lượng Việt Nam đánh giá cấp giấy chứng nhận phù hợp với tiêu chuẩn: TCVN ISO 9001:2000. Từ ngày 7-5-2007 Sở Công nghiệp được phép sử dụng Giấy chứng nhận số 0093/2007 và dấu chứng nhận của QUACERT với dấu công nhận của JAS-ANZ làm bằng chứng cho việc thừa nhận quốc tế. Do mới đưa hệ thống quản lý chất lượng vào áp dụng và là một trong ba đơn vị cấp Sở triển khai thực hiện hệ thống quản lý chất lượng trong công tác quản lý hành chính Nhà nước trên địa bàn tỉnh, nên Sở Công nghiệp đã đưa những thông tin có chọn lọc về hệ thống quản lý chất lượng theo tiêu chuẩn ISO 9001:2000 lên trang Thông tin điện tử Công nghiệp Quảng Ninh nhằm giúp các tổ chức và cá nhân có nhu cầu liên quan đến chức năng quản lý Nhà nước của Sở có thể tìm hiểu và đóng góp nhằm hoàn thiện hệ thống quản lý chất lượng. Trang Thông tin điện tử Công nghiệp còn cung cấp thông tin cho các tổ chức và cá nhân có nhu cầu đến dịch vụ hành chính công biết về các thủ tục hành chính quy định để tránh phiền hà và giảm bớt thời gian đi lại nhiều lần. Trong thời gian tới Sở Công nghiệp sẽ tiếp tục duy trì và cải tiến hệ thống quản lý chất lượng nhằm thoả mãn nhu cầu ngày càng cao của các tổ chức và cá nhân có nhu cầu liên quan đến chức năng quản lý Nhà nước về công nghiệp trên địa bàn.