Thời gian gần đây, nhiều vụ việc kinh doanh thuốc nhập lậu lớn đã được phát hiện. Nghiêm trọng nhất là vụ Sở Y tế TPHCM đã phát hiện tại 3 nhà thuốc trên địa bàn có 45 thùng chứa hàng trăm chủng loại tân dược, tương đương 200 kg thuốc các loại không có hóa đơn chứng từ và số đăng ký của Cục Quản lý dược Việt Nam.
Nếu chưa có yếu tố xử lý hình sự, Sở Y tế sẽ xử phạt hành chính theo Nghị định của Chính phủ về xử lý sai phạm trong hoạt động kinh doanh dược phẩm, đồng thời áp dụng các hình phạt bổ sung như: tước quyền sử dụng giấy phép, chứng chỉ hành nghề, giấy chứng nhận đủ điều kiện hành nghề từ 6 đến 12 tháng, hoặc tước quyền sử dụng không thời hạn. 
Cục Quản lý dược Việt Nam vừa có văn bản chỉ đạo Sở Y tế các tỉnh, thành phải xử lý nghiêm khắc các trường hợp mua bán thuốc không rõ nguồn gốc, trôi nổi trên thị trường, nghi ngờ chất lượng, không có hóa đơn chứng từ.
