Theo quy định của Bộ Y tế, đến hết 2010, các nhà thuốc phải đạt tiêu chuẩn GPP (thực hành tốt nhà thuốc) và đến 1-1-2013 tất cả các quầy thuốc cũng phải đạt tiêu chuẩn này. So với mức bình quân chung của cả nước (đạt 5%), Quảng Ninh là địa bàn xây dựng được hệ thống nhà thuốc đạt tiêu chuẩn GPP có tỷ lệ cao (khoảng 12.5%). Tuy nhiên, để đạt những tiêu chuẩn Bộ Y tế đề ra, các nhà thuốc trên địa bàn tỉnh hiện còn gặp không ít khó khăn.
Nhà thuốc số 1 (TP Hạ Long) thuộc Công ty TNHH Dược phẩm Bạch Đằng đã được cấp chứng nhận đạt tiêu chuẩn GPP.
Mặc dù vậy, để đạt được chuẩn do Bộ Y tế đề ra, đòi hỏi các nhà thuốc phải đầu tư mạnh cả về nhân lực, vật lực. Theo đúng quy định, để mở được nhà thuốc thì nơi đó phải có dược sĩ đại học đứng tên, chịu trách nhiệm. Song Bộ cũng quy định đến hết năm 2010, dược sĩ nhà nước sẽ không được hành nghề tư nhân, trong khi đó hơn 40% trong tổng số 112 nhà thuốc trên địa bàn hiện do dược sĩ đang công tác tại các bệnh viện, trung tâm y tế công lập đứng tên. Nghĩa là trong thời gian tới, những nhà thuốc này muốn tồn tại hoạt động phải tìm được dược sĩ đại học thay thế. Song nguồn dược sĩ đại học hiện nay rất hiếm. Ước tính để đáp ứng được nhu cầu của các đơn vị y tế, các nhà thuốc, công ty trên địa bàn, hiện Quảng Ninh thiếu khoảng 50 dược sĩ đại học. Ngành Y tế tỉnh đang tiến hành rà soát lại ở các địa phương và doanh nghiệp để có kế hoạch đào tạo dược sĩ đại học theo địa chỉ. Tuy nhiên, nếu có đủ người và được đào tạo hết theo chỉ tiêu thì phải đến 2015, may ra Quảng Ninh mới đủ dược sĩ đại học cần thiết. Hiện Nhà nước chưa có chế độ ưu đãi nào dành cho những nhà thuốc tích cực xây dựng chuẩn GPP, trong khi để đảm bảo một nhà thuốc đạt chuẩn, đòi hỏi đầu tư cơ sở vật chất khá tốn kém. Các nhà thuốc này phải bán thuốc theo đơn, doanh thu sẽ hạn chế so với các nhà thuốc chưa thực hiện theo chuẩn do nhận thức của người dân chưa phân biệt được mua thuốc nơi nào tốt hơn. Ngành Y tế tỉnh cũng dự định hướng dẫn các công ty xây dựng chuỗi các nhà thuốc GPP do một dược sĩ đại học đứng tên (theo gợi ý của Bộ Y tế), song điều này cũng khó khăn, bởi mỗi nhà thuốc vẫn phải có người tư vấn, trong khi đó kiến thức về cận lâm sàng, tương tác giữa các loại thuốc của nhiều chủ nhà thuốc hay dược sĩ trung cấp còn hạn chế. Việc phấn đấu đạt lộ trình đến 2013 tất cả các quầy thuốc phải đạt chuẩn GPP với Quảng Ninh lại càng khó khăn hơn, bởi các quầy thuốc, tủ thuốc trạm y tế chủ yếu ở các huyện thị, các xã vùng sâu, vùng xa, cơ sở nhỏ lẻ, manh mún, vốn đầu tư không nhiều...
Hiện ngành Y tế tỉnh đang chịu sức ép lớn, vừa đảm bảo dịch vụ thuận tiện cho dân mua thuốc vừa phải đảm bảo nâng cao chất lượng các nhà thuốc. Nhằm lập lại trật tự trong kinh doanh dược phẩm, mặt hàng đặc biệt tác động lớn đến sức khoẻ người dân, thì việc xây dựng đảm bảo lộ trình GPP là rất cần thiết. Việc xây dựng nhà thuốc, quầy thuốc GPP muốn hiệu quả cần có sự vận động tuyên truyền tích cực không chỉ của ngành Y tế, mà của cả các cấp, các ngành trong tỉnh.