Trong khó khăn chung của tình hình kinh tế - xã hội năm 2008, thuỷ sản là một trong những ngành nặng nề nhất. Đợt rét đậm, rét hại hồi đầu năm 2008 đã làm cho cá nuôi ở các ao đầm, bè nuôi chết hàng loạt.
Thiệt hại nặng nhất là Trung tâm Khoa học kỹ thuật và Sản xuất giống thuỷ sản đã bị chết mất 40 cặp bố mẹ cá chim trắng, 8.000 con cá rô phi bố mẹ, 345.000 con cá rô phi giống lưu giữ qua đông, toàn bộ số cá chim trắng nuôi thịt bị chết rét… Đến cuối tháng 9-2008, do chịu ảnh hưởng của cơn bão số 6, các huyện miền Đông đã bị mất gần 900 ha nuôi tôm, cá, thiệt hại hơn 18 tỷ đồng. Cũng trong năm giá dầu, vật tư ngư lưới cụ tăng cao nên đã ảnh hưởng lớn tới hoạt động khai thác của ngư dân. Cộng với đó do tình hình kinh tế thế giới suy giảm nên việc xuất khẩu sản phẩm thuỷ sản của các doanh nghiệp trong ngành cũng gặp rất nhiều khó khăn. Vượt qua những khó khăn này, năm 2008 tổng sản lượng thuỷ sản đạt toàn tỉnh 73.891 tấn (trong đó có 10.480 tấn sứa của ngư dân các huyện Cô Tô, Vân Đồn, Hải Hà khai thác được), vượt 16,9% kế hoạch đề ra. Giá trị xuất khẩu tiểu ngạch ước đạt 18,1 triệu USD. Toàn tỉnh đã đưa vào nuôi 19.678 ha, trong đó nuôi tôm 10.542 ha, nuôi nước ngọt 3.000 ha, nuôi nhuyễn thể 2.000 ha và 7.235 ô nuôi lồng bè.
Đầm nuôi tôm của các hộ dân phường Hải Hoà (TP Móng Cái) đang được phơi đáy chuẩn bị cho vụ thả nuôi xuân hè 2009.
Trong vài năm gần đây phong trào nuôi nhuyễn thể đã bắt đầu phát triển mạnh mẽ ở các địa phương có diện tích bãi triều lớn. Điển hình như huyện Vân Đồn xuất hiện các mô hình nuôi ốc ở xã đảo Ngọc Vừng, nuôi nghêu ở xã Minh Châu, nuôi tu hài ở xã Bản Sen. Đến nay nuôi tu hài đã được người dân đặc biệt quan tâm. Nếu như năm 2006 toàn huyện Vân Đồn chỉ có 65 hộ tham gia nuôi tu hài thì đến nay con số này đã tăng lên gấp nhiều lần, số lượng con giống thả nuôi lên tới 12 triệu con/năm. Sản lượng cho thu hoạch năm 2008 đạt 500 tấn, dự kiến năm 2009 đạt khoảng 800-1.000 tấn. Nuôi nhuyễn thể không chỉ thu hút được người dân tham gia mà các doanh nghiệp cũng đã bỏ vốn đầu tư vào lĩnh vực này. Để đáp ứng nhu cầu con giống cho người nuôi từ năm 2007, Trung tâm Khoa học Kỹ thuật và Sản xuất giống thuỷ sản đã triển khai đề tài sản xuất giống ốc nhảy tại Vân Đồn, Công ty TNHH Đỗ Tờ nghiên cứu sản xuất giống tu hài.
Điểm nổi bật trong hoạt động của ngành Thuỷ sản năm 2008 đó là do giá dầu tăng cao nên Chính phủ quyết định hỗ trợ tiền dầu cho ngư dân, các địa phương, cơ quan chức năng đã tích cực vào cuộc thực hiện công tác giải ngân nguồn vốn hỗ trợ. Hết năm 2008, toàn tỉnh đã giải ngân được gần 80 tỷ đồng, với tổng số phương tiện được hỗ trợ là 6.186 chiếc. Trong đó: Huyện Yên Hưng giải ngân được 25,4 tỷ đồng, Hải Hà 18,9 tỷ đồng, Vân Đồn 8,1 tỷ đồng, Đầm Hà 6,5 tỷ đồng, Hạ Long 5,7 tỷ đồng, Cô Tô 4 tỷ đồng, Móng Cái 2,5 tỷ đồng, Cẩm Phả 1,9 tỷ đồng, Đông Triều 1,8 tỷ đồng, Uông Bí 1,5 tỷ đồng, Tiên Yên 1 tỷ đồng, Hoành Bồ 160 triệu đồng. Cùng với việc tổ chức thực hiện giải ngân nguồn vốn hỗ trợ ngành NN&PTNT tiếp tục phối hợp với các địa phương tổ chức sắp xếp lại lực lượng khai thác hải sản xa bờ theo hướng cơ cấu lại nghề nghiệp một cách hợp lý. Hướng dẫn, hỗ trợ các hộ ngư dân khai thác khu vực ven bờ sang nuôi trồng thuỷ sản và làm dịch vụ, hướng dẫn đội tàu khai thác xa bờ tham gia vào vùng đánh cá chung Vịnh Bắc Bộ. Điều đáng mừng của hoạt động thuỷ sản năm qua đó là mặc dù thị trường xuất khẩu chính ngạch rất khó khăn nhưng kim ngạch xuất khẩu thuỷ sản vẫn đạt cao hơn so với cùng kỳ, do biết khai thác lợi thế của tỉnh có đường biên giới trên biển nên giá trị xuất khẩu tiểu ngạch vượt kế hoạch đề ra.
Đánh giá về những tác động đến sự phát triển ngành kinh tế thuỷ sản trong năm 2009 nhiều chuyên gia nhận định về mặt thời tiết có thể vụ nuôi xuân hè sẽ thuận lợi hơn. Tuy nhiên, cần phải đặc biệt quan tâm đến vấn đề phòng chống dịch bệnh, vì thời tiết càng ấm càng thuận lợi bao nhiêu thì các đối tượng bệnh lại càng phát sinh phát triển mạnh bấy nhiêu. Việc xuất khẩu thuỷ sản sẽ gặp khó khăn hơn do nền kinh tế thế giới đang suy giảm mạnh. Vì vậy với lợi thế của tỉnh công nghiệp, du lịch cần tập trung khai thác thị trường nội địa. Phát huy lợi thế của tỉnh là 1 trong 4 ngư trường trọng điểm của cả nước cần tiếp tục củng cố, phát triển đội tàu đánh bắt xa bờ, tổ chức lại sản xuất trên biển, hình thành các tổ chức kinh tế hợp tác theo tổ, đội, nhóm tàu tiến tới khép kín từ khâu khai thác đến hậu cần dịch vụ trên biển. Cùng với việc phát triển khai thác xa bờ cần chú trọng bảo vệ nguồn lợi và môi trường vùng ven bờ để phát triển bền vững.
