Theo quy chế của Bộ GD-ĐT, kỳ thi tốt nghiệp THPT, bổ túc THPT năm học 2008-2009 đổi chéo chấm bài thi tự luận giữa các tỉnh, thành phố trong cả nước theo nguyên tắc không đối trọng lẫn nhau (bài thi các môn thi trắc nghiệm của tỉnh nào chấm tỉnh đó).
Bài thi môn tự luận của thí sinh Quảng Ninh được chuyển đến chấm tại tỉnh Bắc Ninh (Hội đồng chấm thi tỉnh Quảng Ninh chấm bài thi tự luận của thí sinh tỉnh Hưng Yên). Sau khi công bố kết quả thi, trong thời gian quy định của Bộ GD-ĐT (trong vòng 10 ngày sau khi biết kết quả), đã có hơn 200 bài thi của thí sinh đề nghị được phúc khảo. Trong đó, 173 bài thi là các môn tự luận (Ngữ Văn, Toán, Địa lý) và 34 bài thi là các môn trắc nghiệm (Ngoại ngữ, Vật lý, Sinh học đối với học sinh khối THPT và Hoá học đối với học sinh khối GDTX).
Theo tin từ HĐ chấm thi tỉnh Quảng Ninh, tỉnh Hưng Yên có 500 bài thi đề nghị phúc khảo. Tuy nhiên, chỉ có 2 bài thi có kết quả chấm thi thay đổi 1 điểm so với điểm chấm ban đầu. Được biết, kết quả bài thi phúc khảo sẽ được công bố trước ngày thi đợt 1 của kỳ thi tuyển sinh ĐH, CĐ năm 2009.
